Центр является подведомственным Федеральной службе по надзору в
сфере образования и науки учреждением.
Центр был учрежден Министерством общего и профессионального
образования Российской Федерации 20 марта 1997 г.
16 мая 2002 г. Центр был переименован в государственное научное
учреждение «Главный государственный экспертный центр оценки
образования Министерства образования Российской Федерации», в
последующем передан из ведения Министерства в Федеральное агентство
по образованию.
8 декабря 2004 г. Центр переименован в федеральное государственное
научное учреждение «Главный государственный экспертный центр оценки
образования», такое наименование используется и в настоящее
время.
28 июня 2005 г. Распоряжением Правительства Российской Федерации №
892-р Центр был передан в ведение Федеральной службы по надзору в
сфере образования и науки (Рособрнадзор).